上海2022年2月9日 /美通社/ -- 2022年2月8日,Science 在線發(fā)表了中國科學(xué)院上海藥物研究所徐華強(qiáng)教授/尹萬超博士團(tuán)隊(duì)與濟(jì)民可信鄧俗俊博士團(tuán)隊(duì)合作的題為“Structures of the Omicron spike trimer with ACE2 and an anti-Omicron antibody”的最新成果(刊出地址:https://www.science.org/doi/10.1126/science.abn8863 )。 該研究解析了Omicron刺突蛋白與人源受體ACE2或廣譜抗新冠抗體JMB2002復(fù)合物的高分辨冷凍電鏡結(jié)構(gòu),闡述了Omicron變異株傳播迅速和免疫逃逸的分子機(jī)制,并揭示了治療抗體JMB2002全新的作用機(jī)制,為JMB2002對(duì)新冠病毒Omicron變異株仍具有中和功能及進(jìn)一步開展臨床試驗(yàn)研究提供了理論基礎(chǔ)。為廣譜抗新冠抗體的研發(fā)提供了新的思路,也可為全球新冠疫苗研發(fā)提供新的參考。
研究者發(fā)現(xiàn)Omicron刺突蛋白結(jié)合其受體ACE2相比于野生型提高6-9倍,通過解析Omicron變異株刺突蛋白與人源受體蛋白ACE2復(fù)合物的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu)(圖1A),從結(jié)構(gòu)中觀察到Omicron刺突蛋白三聚體相鄰的RBD存在相互作用(圖1B),利于Omicron刺突蛋白的RBD持續(xù)處于開放狀態(tài),增強(qiáng)了Omicron變異株的傳染性;結(jié)合熱動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Omicron刺突蛋白的RBD高度靈活且不穩(wěn)定,其熱溶解溫度降了超過5攝氏度(圖1C),使得刺突蛋白更容易從閉合構(gòu)象向開放構(gòu)象轉(zhuǎn)換,進(jìn)一步增強(qiáng)Omicron變異株的傳染性。簡(jiǎn)而言之,Omicron刺突蛋白R(shí)BD的相互作用及不穩(wěn)定性,促進(jìn)Omicron刺突蛋白與ACE2的相互作用,從原子水平解釋了Omicron變異株傳染性增強(qiáng)的潛在機(jī)制。
圖1 Omicron刺突蛋白結(jié)合人源受體ACE2的結(jié)構(gòu)。A展示Omicron刺突蛋白結(jié)合人源ACE2結(jié)構(gòu)的整體構(gòu)象,B為RBD-RBD二聚體,以及RBD結(jié)合ACE2的相互作用界面,C為刺突蛋白的熱穩(wěn)定結(jié)果。
從解析的結(jié)構(gòu)中看到Omicron刺突蛋白的眾多突變位點(diǎn)位于蛋白表面,導(dǎo)致了大部分中和抗體對(duì)Omicron突變株失去了中和活性。值得慶幸的是,濟(jì)民可信自主研發(fā)的新冠中和抗體JMB2002對(duì)Omicron刺突蛋白的親和力是對(duì)野生型的4倍,展示出強(qiáng)大的抑制Omicron變異株的潛力。為闡述JMB2002抗Omicron變異株的分子機(jī)制,研究者解析了Omicron刺突蛋白與JMB2002復(fù)合物的結(jié)構(gòu)(圖2A-C);從結(jié)構(gòu)中發(fā)現(xiàn)Omicron刺突蛋白三聚體內(nèi)同樣存在RBD相互作用(圖2D),JMB2002抗體結(jié)合Omicron刺突蛋白R(shí)BD后阻礙了人源受體蛋白ACE2與RBD的結(jié)合(圖2E);令人驚奇的是,JMB2002以一種全新的構(gòu)象結(jié)合在RBD與人源ACE結(jié)合界面的背部,是一種全新的結(jié)合表位的中和抗體(圖2F)。
圖2 Omicron刺突蛋白結(jié)合抗體JMB2002的結(jié)構(gòu)。A展示JMB2002抗體結(jié)合Omicron刺突蛋白的整體結(jié)構(gòu),B復(fù)合物中Omicron刺突蛋白的構(gòu)象,C為與JMB2002抗體結(jié)合的兩個(gè)RBD的結(jié)構(gòu)比較,D為JMB2002抗體結(jié)合Omicron刺突蛋白的結(jié)構(gòu)中RBD-RBD的二聚體,E展示了JMB2002抗體結(jié)合Omicron的RBD后阻斷ACE2進(jìn)一步結(jié)合,F(xiàn)為抗新冠病毒中和抗體的分類,JMB2002抗體為新型抗體,被歸為第五類。
在新冠病毒變異株Omicron大流行之際,本次研究成果極具原創(chuàng)性與新穎性,論文通過同行評(píng)審并在Science發(fā)表,將助力全球科研工作者充分了解Omicron變異株的特性,為JMB2002對(duì)新冠病毒Omicron變異株仍具有中和功能及進(jìn)一步開展臨床試驗(yàn)研究提供了理論基礎(chǔ)。為廣譜抗新冠抗體的研發(fā)提供了新的思路,也可為全球新冠疫苗研發(fā)提供新的參考。
上海藥物所徐華強(qiáng)教授團(tuán)隊(duì)主要成員和濟(jì)民可信鄧俗俊博士團(tuán)隊(duì)主要成員為該文的共同第一作者。上海藥物所徐華強(qiáng)教授、尹萬超研究員和濟(jì)民可信鄧俗俊博士為該文共同通訊作者。