北京2017年11月20日電 /美通社/ -- 自精準醫(yī)療提出以來，國內(nèi)外涌現(xiàn)出一大批生物基因檢測公司，開展基因檢測服務。通過高通量測序已經(jīng)積累的龐大基因數(shù)據(jù)，為疾病診斷、分型、藥物研發(fā)等提供了新方向及工具。但隨著海量基因及健康數(shù)據(jù)的產(chǎn)生，企業(yè)在數(shù)據(jù)管理的需求上面臨著巨大的壓力和挑戰(zhàn)，如何精細化運營這些數(shù)據(jù)，實現(xiàn)數(shù)據(jù)匹配應用，隨之有效進行存儲和管理，逐漸成為生物基因公司共同面臨的問題。
11月17日，由榮之聯(lián)和英特爾聯(lián)合主辦的“基因大數(shù)據(jù)平臺應用實踐高峰論壇”在國家游泳中心北五環(huán)咖啡館順利召開。本次論壇圍繞生物基因大數(shù)據(jù)平臺應用實踐，眾多技術專家就基因數(shù)據(jù)的有效管理和應用等話題展開討論。
測序中國聯(lián)合創(chuàng)始人、COO商元博主持了本次論壇。
極道科技聯(lián)合創(chuàng)始人、總經(jīng)理吳江，是國內(nèi)知名的存儲系統(tǒng)、分布式數(shù)據(jù)系統(tǒng)專家，中國計算機協(xié)會信息存儲專業(yè)委員會委員。吳江在“生物信息應用驅動的數(shù)據(jù)系統(tǒng)”的報告中，講到極道科技的生物數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng)，包括存、管、算、察四方面及其生物數(shù)據(jù)流，目的就是要實現(xiàn)數(shù)據(jù)的有效存儲、發(fā)現(xiàn)、調度和轉化。吳江表示：“單獨的基因組數(shù)據(jù)文件并不是有效的大數(shù)據(jù)，還需要結合臨床表型數(shù)據(jù)。沒有完美存儲，只有合適的應用。目前，沒有任何一種存儲方式可以解決所有的需求問題，我們要用計算換空間，還要重視數(shù)據(jù)感知。”
Intel 公司亞太區(qū)生命科學業(yè)務負責人李健，是“英特爾精準醫(yī)療伙伴計劃”的主要發(fā)起者和負責人，他的報告題目為“精準醫(yī)療計算領域的機遇挑戰(zhàn)與方案創(chuàng)新”。在報告中，李健表示，近幾年，大批跨界巨頭涌入基因行業(yè)的驅動力就是精準醫(yī)學。基因行業(yè)的快速發(fā)展正是因為各種實際和潛在的應用需求。李健分析了目前全球精準醫(yī)療市場面臨的機遇與挑戰(zhàn)，并提出了應對對策，最后李健表示，希望業(yè)內(nèi)能夠以一個開放的心態(tài)，共享標準化的數(shù)據(jù)，進一步挖掘數(shù)據(jù)價值。英特爾的愿景就是和中國生態(tài)伙伴協(xié)作創(chuàng)新，力促實現(xiàn)“24小時精準醫(yī)療”。
Intel 公司醫(yī)療與生命科學部首席架構師丁華，專注于醫(yī)療與生命科學領域的解決方案和應用模式的創(chuàng)新，負責英特爾在生命科學和精準醫(yī)療領域的技術解決方案。丁華的報告題目同樣為“精準醫(yī)療計算領域的機遇挑戰(zhàn)與方案創(chuàng)新”，簡要分析了目前行業(yè)內(nèi)的挑戰(zhàn)，包括規(guī)模、速讀、調度和拓展四方面。通過應用實例詳細介紹了英特爾目前的研究進展，丁華表示英特爾推出的 BIGstack 一體機平臺的初衷就是，創(chuàng)造一個經(jīng)過驗證的 GATK 環(huán)境，使硬件設施有參考，實現(xiàn)來源共享，最終推動行業(yè)的發(fā)展。
中科晶云副總經(jīng)理孫亮博士，中科院計算所副研究員，中科信息產(chǎn)業(yè)研究院精準醫(yī)學研究所副所長，主要研究領域：機器學習、大數(shù)據(jù)分析挖掘、生物信息軟件研發(fā)等，孫亮博士為大家報告了“組學數(shù)據(jù)解讀的私有云解決方案”。孫亮博士簡要介紹了生物信息在精準醫(yī)學中的重要作用，詳細介紹了中科晶云的私有云系統(tǒng)。孫博士表示晶云的存儲、分析、解讀云平臺面向兩類分析場景：基因遺傳病遺傳學分析和基因遺傳病系譜分析，直擊最可能的致病變異，讓報告更加完善。晶云從始至終，專注做好收集、存儲、分析、解讀臨床數(shù)據(jù)，對疾病精準分型，實現(xiàn)更好的個性化健康管理。
烈冰生物創(chuàng)始人、技術總監(jiān)宗杰博士，專注于基因組測序和基因組學相關的生物信息數(shù)據(jù)分析、算法開發(fā)、數(shù)據(jù)庫構建和平臺搭建工作，帶領團隊開發(fā)了國內(nèi)領先的基因測序云計算平臺 NovelBrainTM。宗杰博士以“基因數(shù)據(jù)在云端遇到的那些坑”為題進行報告，簡單介紹了烈冰科技云平臺的發(fā)展歷史，概述了烈冰云平臺的優(yōu)勢，包括高度定制化、隨時添加 panel 運行、CPU 實時監(jiān)控等。宗杰博士重點講述了烈冰科技云平臺在上線過程中遇到的問題和困難實例，并用幽默風趣的方式分析了對應的解決與改進方案。
在最后的圓桌論壇中，吳江，李健，丁華，孫亮博士，宗杰博士，安諾優(yōu)達技術總監(jiān)楊吉濤博士等各位技術專家就“未來生物基因數(shù)據(jù)如何精準有效的管理”進行了多輪討論，并分別發(fā)表了獨到的見解。
